A、核磁共振影像的软组织对比度在某些区域，如脑部，不如ct图像的好

B、MRI扫描的物理尺寸和它的附件不会限制患者体位固定设备的使用和治疗体位的选择

C、骨信号的缺失，使得核磁共振影像无法产生与射野验证片相比较的DRR

D、MRI也有电子密度的信息，进行计量运算时可以进行组织不均匀的修正

E、MRI容易产生几何回应和失真，但不影响计量分布计算和治疗的准确性