A、参加反应的两条核酸链都游离在溶液中

B、操作简便，容易实现自动化，因此应用普遍

C、杂交后过量的未杂交的探针的去除比较困难

D、同源与异源的DNA分子在杂交程中可发生竞争，使结果分析困难

E、常见的杂交方法包括发光法、夹心法、吸附法、复性速率法等